À l'insu des humains, une guerre féroce fait rage sur Terre depuis des milliers d'années. Malgré leur apparence docile, deux clans à l'instinct de guerrier s'affrontent sans merci. C'est une guerre si bien tenue au secret qu'elle pourrait avoir lieu dans votre maison sans que vous ne le sachiez! Les chats et les chiens, vos doux animaux de compagnie, ont quelques différends à régler! Mais l'endroit où ces chères bêtes perdent le plus de poils est à la résidence des Brody.

M. Brody, professeur émérite, travaille sans relâche à l'élaboration d'un vaccin contre l'allergie aux chiens. Une découverte grandement attendue par la population canine mais fort redoutée par la population féline. Car advenant qu'un tel vaccin voit le jour, les chiens deviendraient les animaux de compagnie favoris. Les chats, qui complotent secrètement au renversement de la suprématie des humains pour ainsi devenir l'espèce dominante, n'auraient alors plus aucune chance de voir leur plan se concrétiser.

M. Tinkles, un vieux chat à la mine patibulaire, appelle donc à la solidarité de ses confrères et consoeurs afin de mettre à un terme aux recherches du vaccin. La victoire n'est toutefois pas chose faite : Lou, le petit chien des Brody, est assigné à la protection de son maître et du vaccin en expérimentation. Ivy, l'ange gardien aux sages conseils, Sam, le gros toutou, et Peek, le spécialiste en électronique, sont là pour l'aider.