Il était une fois Kuzco, un jeune empereur méprisé par ses sujets et capricieux de caractère qui vivait des jours paisibles au milieu de ses richesses, bien à l'abri, loin des souffrances de son peuple qu'il délaissait...

Un jour, Kuzco décide de construire une somptueuse résidence d'été, sur le sommet de la plus belle des collines de l'empire. Il fait venir le chef du village concerné, l'imposant Pacha, et le prévient qu'il va rasé sa demeure pour avoir le loisir de construire la sienne...

Mais à l'occasion d'un nouveau caprice, n'écoutant une fois de plus que son bon plaisir, l'empereur Kuzco congédie son premier conseillé, la perfide diablesse Yzma. Folle de rage, la diablesse secondée de son sbire Kronk le musclé, échafaude alors un plan de vengeance pour ravir enfin le trône de Kuzco ; elle change le capricieux empereur en lama. Perdu dans un environnement hostile et inconnu, dépouillé de ses prérogatives, Kuzco trouve de l'aide dans Pacha, l'homme qu'il voulait ruiné.

Pourquoi un homme bon et intègre tel que Pacha voudrait-il sauver celui qui a promis de dévaster sa vie ? Afin de retrouver son rang, Kuzco devra faire un long chemin, sur son vécu et sur les considérations qu'il entretenait sur la nature humaine. Il devra plus encore tenter d'échapper à la terrible vengeance de Yzma car rien ne sera épargné au petit empereur changé en lama et à son nouveau compagnon Pacha.