Il y a 140 ans, lors de la période mouvementée qui marqua la fin de l'ère Tokugawa, un samouraï nommé Battosai l'assassin vivait à Kyoto. Tueur redoutable, il laissait derrière lui de véritables carnages, nourrissant ainsi l'espoir de voir s'ouvrir une nouvelle ère. mais alors que la guerre civile s'achevait, il disparut. Nul ne sait ce qu'il est devenu. mais son nom, batosai l'assassin, est désormais entré dans la légende...