Albator et son équipage sont à la recherche d'une planète idéale où la paix regnerait. La Terre et une partie de l'univers sont sous la coupe des humanoïdes, et ces derniers font tout pour éliminer le célèbre corsaire. C'est principalement le professeur Zon, un terrien, qui va donner la chasse à Albator. Mais celui-ci n'est pas seul dans l'univers. A bord du formidable Atlantis, concu par le génial Alfred, il peut compter aussi sur la belle Emeraldas, ou encore sur l'oasis de l'espace, une base conçue par Alfred cachée dans une comète artificielle. De nombreux dangers attendent Albator, avant de pouvoir trouver enfin sa planète idéale...