La nouvelle guerre de digimons aura lieu sur le net.

Un tout nouveau digimon voit le jour et celui-ci est encore plus efficace que les autres. Il intègre les données digitales à une vitesse hallucinante. Ce digimon de l'Internet se transforme bientôt en digigantesque et élabore l'invasion nucléaire du Japon grâce à sa maîtrise de tous les moyens de communication.

Seul un groupe d'enfants aidé d'un super digimon pourrait empêcher cette catastrophe.